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羊痘病毒(GaPV)核酸檢測試劑(熒光PCR法,外源內標)
點擊次數:485 更新時間:2024-08-07

羊痘病毒(GaPV)核酸檢測試劑(熒光PCR法,外源內標


 

包裝規格:48 T/

產品說明:

采用Taqman探針技術,以羊痘病毒(GaPV,羊痘病毒屬包含綿羊痘病毒、山羊痘病毒和牛結節性皮膚病病毒等3種病毒)特異性保守基因為靶位點設計特異性引物和探針,用于樣品中GaPV核酸的輔助檢測。本產品引入了dUTP / UDG 系統,可降解含UssDNAdsDNA,消除由PCR產物導致的交叉污染。 同時設置陽性內對照 (即內標,使用VIC報告基團),通過檢測內標是否正常來監測qPCR體系中是否含有 PCR抑制物,避免出現假陰性結果。

產品組成:


組分名稱

主要成分

DV231Y-21-V1

1

GaPV PreMix-2

qPCR反應緩沖液、dNTPsUDG酶、Taq酶、引物、探針

960  μL/

2

GaPV陰性對照-2

無酶水

400  μL/

3

GaPV內標對照-2

含內標擴增片段的核酸

480  μL/

4

GaPV陽性對照-2

含目標擴增片段的核酸

50  μL/

注:不同批號產品的成分之間不可以混用或互換!!!

儲存條件和保質期:

-20±5避光儲存,有效期12月。干冰運輸。重復凍融小于5次。生產日期,失效日期請見外包裝盒。

適用儀器:

ABI7500宏石96PBio-Rad CFX96實時熒光PCR儀等。

樣品要求:

1、適用樣品類型

活體或剖檢牛羊的皮膚丘疹、肺部病變組織、淋巴結、血液等樣品

要求送檢新鮮樣品,禁止反復凍融!

2、樣品處理(核酸提取區)

參照NY/T 541-2016 獸醫診斷樣品采集、保存與運輸技術規范》等標準進行樣品前處理, 使用商業化的提取試劑盒提取樣品中的核酸。提取時,每200 μL陰性對照處理后的樣品溶液中添加10 μL內標對照,提取后的核酸應立即檢測,否則凍存于-20±5,保存時間不超過6個月,禁止反復凍融

*內標對照的其它使用方:將內標對照混入 qPCR工作液中,但僅僅質控擴增過程和監測qPCR體系中是否含有 PCR抑制物,不能質控提取核酸過程

檢測方法

為了防止污染,實驗需分區操作!!!

注:核酸提取參照樣品要求,在核酸提取區進行或在樣品處理區進行。

1、試劑準備 (在試劑準備區進行)

(1) 推薦方式(內標對照質控核酸提取和核酸擴增過程)

取出試劑盒中的各組分以及自備試劑,室溫放置,待溫度平衡至室溫,混勻后備用;

根據檢測樣品數量,建議每次檢測均設置陰性對照和陽性對照。將所需數量(N)的GaPV PreMix-2分配到每個微離心管(如八連管)中,20 μL/管。待檢樣品數為n時,所需反應數N=樣品數(n)+陽性對照(1)+陰性對照(1)

當準備使用時,再轉移到樣品處理區。

(2) 其它方式內標對照僅質控核酸擴增過程

根據所檢測的樣品數量按照下表配制反應液,建議每次檢測均設置陰性對照和陽性對照。待檢樣品數為n時, 需配制反應體系數N=待檢樣品數(n) +陽性對照(1)+陰性對照(1)+1

*qPCR工作液配制表(其它方式)

組份

每反應體積(μL)

GaPV PreMix-2

20 μL×N

GaPV內標對照-2

0.5 μL×N

*注:本配制方法為在提取樣品核酸未加內標對照時的補救方法,不推薦。

將配制好的qPCR工作液充分混勻后瞬時離心,待用;當準備使用時,將等量的20 μL分配到每個微離心管(如八連管)中,并轉移到樣品處理區。

2、樣品加樣 (在樣品處理區進行)

 在每個PCR管中加入5 μL經提取的待測樣品和陰性對照、陽性對照,蓋上管蓋, 瞬時離心,使液體全部沉于管底。

3qPCR擴增 (在擴增與分析區進行)

 (1) 熒光通道選擇

熒光基團選擇FAM通道檢測GaPV;選擇VIC 通道檢測內標;淬滅基團設置為none。如ABI qPCR儀,還需設置Passive Referencenone。其它儀器參考儀器說明書。

(2) qPCR擴增程序設置

設置反應體系為25 μL

 

步驟

溫度

反應時間

循環

UDG消化

50

5 min

1

預變性

95

30 sec

1

擴增

變性

95

5 sec

45

退火與延伸

60

35 sec,數據收集

4、結果分析 (ABI7500 qPCR儀為例)

反應結束后,qPCR儀將自動生成結果。若儀器自動生成的擴增曲線或閾值線有異常,用戶可根據實際情況自行調整,基線Start值可以在 3~10,基線End值可設在 5~20,調整各擴增曲線的基線區相對水平即可。點擊Analyze 進行分析。

5、質量控制

試劑盒中各控制項應符合下列要求,否則實驗無效。


陽性對照

陰性對照

FAM通道GaPV

Ct32

Ct值或Ct>40

VIC通道

(內標)

Ct值或Ct>40

典型的S形曲線,Ct35

參考qPCR工作液配制表(其它方式)配制時,陽性對照的VIC通道應出現S型曲線,Ct35

檢驗結果的解釋

(1)若樣品的VIC通道呈典型的S形曲線且Ct35時,

A. FAM通道Ct35,判定為GaPV陽性

B. FAM通道Ct值在3540之間時,需要觀察靶基因的擴增曲線是否呈S形,如果曲線呈S形,樣品應視為疑似GaPV陽性,需重新檢測;復測結果若Ct值≦40且具有典型S形曲線,判定為GaPV陽性;反之若為無Ct顯示Ct>40或無典型S形曲線,則判定為GaPV陰性。

C. FAM通道Ct>40,判定為GaPV陰性

2)如果VIC通道的Ct值高于35,而沒有顯示明顯的S形擴增曲線,原因如下:

1) 樣品中存在PCR抑制劑,建議實驗前稀釋模板

2) 核酸提取操作存在缺陷,建議重復核酸提取進行檢測

3) 在處理過程中沒有獲得合格的樣品,或者在運輸和儲存過程中樣品已經降解,建議重新采樣。

檢驗方法的局限性

1) 陰性結果可能是由于從樣品中提取的核酸質量低,儲存條件不當,儲存期不合適,樣品中存在抑制劑,核酸降解和核酸提取方法的提取效率差等原因。

2) 不合理的樣品采集、運送與保存條件,樣品中病毒含量過低,或不合理的實驗操作和環境很可能造成假陰性或假陽性結果。其它臨床觀察和相關資料應結合測定,必要時再次進行檢測。

3) 由于突變或其它原因,靶序列的序列變化可能會產生假陰性結果。

注意事項:

1) 本產品僅用于科研使用,使用前請仔細閱讀本說明書。

2) 實驗前請熟悉和掌握需使用的各種儀器的操作方法和注意事項,對每次實驗進行質量控制。

3) 實驗室管理需嚴格遵照PCR基因擴增實驗室的管理規范,實驗人員必須進行專業培訓,實驗過程嚴格分區進行, 所有消耗品僅作一次性使用,實驗操作的每個階段使用專用儀器和設備,各區各階段用品不可交叉使用。

4) 所有檢測樣品均視為具有傳染性的物質,實驗過程中穿工作服并經常更換手套,以避免樣品間的交叉污染;

5) 樣品操作、廢棄物處理應符合相關法規要求:《微生物生物醫學實驗室生物安全通用準則》和《醫療廢物管理 條例》。

6) 所有試劑 (包括本產品中的組分與客戶自備試劑) 使用前均需徹底化凍、混勻。

7) 液類樣品溶血嚴重時,會使擴增曲線高度顯著下降。因此,當使用該試劑盒同時檢測血樣品原液和生理鹽水稀釋 樣品時,建議對2類模板分別設置不同的閾值線,以保證結果的準確性。

8) 當出現多個樣品的Ct>40時,可能是qPCR儀自動生成的閾值線較高的原因,建議將閾值線高度設置在擴增曲線 最大熒光值的1/15左右后,重新分析。

本產品僅供科研使用,檢測結果不能用作臨床診斷判斷唯一依據

2011年開始我們致力于在生命科學領域生物醫學實驗技術及論文潤色服務,協助客戶各類實驗服務及論文潤色十多年,是您值得信賴的科研合作伙伴!

如果您受時間、試驗條件等限制而無法完成您的課題研究,歡迎您與我們聯系。

 

實驗技術服務:

 


滬公網安備 31011802001676號

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